MODELISATION DES MALADIES INFECTIEUSES (Ref. RI-006)

Enseignement dispensé en langue anglaise.

L'objectif de ce cours, délivré dans le cadre du Pôle d'Épidémiologie  et Santé Publique (EPI), est de fournir aux étudiants ayant une formation scientifique, médicale ou en santé publique, une introduction en modélisation des maladies transmissibles.

Pré-requis: Niveau licence ou équivalent. Connaissances de base en algèbre (matrices) et en analyse (dérivées) sont recommandées, mais pas obligatoires.

Ce cours a pour objectif de donner à des étudiants en sciences, médecine ou santé publique une formation initiale à la modélisation mathématique des maladies infectieuses. La formalisation de l'histoire naturelle d'une maladie infectieuse sous forme de modèle compartimental sera décrite, ainsi que les méthodes de résolution déterministe et stochastique. Des méthodes d'analyse basées sur les processus de branchements seront également décrites. L'utilisation de données décrivant les réseaux sociaux complexes sera également présentée. Finalement, l'analyse d'incertitude et de sensibilité de tels modèles sera expliquée.

Le taux de reproduction d'une épidémie, notamment le taux de reproduction initial R0, sera défini. Les méthodes de calcul seront exposées dans le cas général; l'estimation à partir de données sera également abordée. L'utilisation du R0 pour prévoir l'impact d'une intervention sera discutée.

Les cours présenteront des aspects théoriques, en s'appuyant sur des exemples tirés de la littérature.