Département Risque infectieux
Régis Pouillot est Docteur en médecine vétérinaire (Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort - Faculté de Médecine de Créteil) et Docteur en biostatistique (Faculté de Médecine Paris XI). Ingénieur de Recherche à l'Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments dès sa création, il a orienté sa recherche et son expertise sur l'appréciation quantitative du risque, notamment dans le domaine des risques microbiens présents dans les aliments. De 2004 à 2007, il a dirigé le Laboratoire d'Epidémiologie et de Biostatistique du Centre Pasteur du Cameroun. Depuis, il poursuit ses travaux de recherche appliquée au sein de l'équipe de coordination des évaluations des risques du Center for Food Safety and Applied Nutrition, Food and Drug Administration, à College Park (Maryland, USA). Publications principales dans le domaine de l'évaluation des risques liés aux aliments : Gimou, M.M., U.R. Charrondiere, J.C. Leblanc and R. Pouillot (2008) Dietary exposure to pesticide residues in Yaoundé: the Cameroonian total diet study. Food Additives and Contaminants. 25(4):458-71. Pouillot R, N. Miconnet, A.L. Afchain, M.L. Delignette-Muller, A. Beaufort, L. Rosso, J.B. Denis and M. Cornu (2007) Quantitative risk assessment of Listeria monocytogenes in French cold-smoked salmon: I. Quantitative exposure assessment. Risk Analysis. 27(3):683-700. Delignette-Muller, M. L., M. Cornu, R. Pouillot and J. B. Denis (2006). "Use of Bayesian modelling in risk assessment: application to growth of Listeria monocytogenes and food flora in cold-smoked salmon. International Journal of Food Microbiology. 2006 Feb 1;106(2):195-208. Pouillot, R., P. Beaudeau, J. B. Denis and F. Derouin (2004). "A quantitative risk assessment of waterborne cryptosporidiosis in France using second-order Monte Carlo simulation." Risk Analysis 24(1): 1-17. Pouillot, R., I. Albert, M. Cornu and J. B. Denis (2003). "Estimation of uncertainty and variability in bacterial growth using Bayesian inference. Application to Listeria monocytogenes." International Journal of Food Microbiology 81(2): 87-104.
Jean-Christophe Augustin est docteur en médecine vétérinaire et docteur en microbiologie (université Claude Bernard Lyon 1). Il est actuellement maître de conférences en hygiène des aliments à l'Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort. Il est co-directeur du cours sécurité sanitaire des aliments et analyse de risques de l'Ecole Pasteurienne d'Infectiologie et co-responsable du cours maîtrise de la sécurité sanitaire des aliments de l'Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort. Ses principaux thèmes de recherche sont la modélisation du comportement des bactéries pathogènes dans les aliments, la performance des méthodes de détection et de quantification des micro-organismes dans les aliments et l'évaluation des risques sanitaires liés aux aliments. Publications : Augustin, J.-C., Brouillaud-Delattre, A., Rosso, L., Carlier, V. 2000. Significance of inoculum size in the lag time of Listeria monocytogenes. Appl. Environ. Microbiol. 66, 1706-1710. Augustin, J.-C. 2003. Evaluation of the sensitivity of microbiological criteria for Listeria monocytogenes in detecting unsafe food according to the prevalence of the pathogen and the shelf-life of the food. Food Microbiol. 20, 681-689. Guillier, L., Pardon, P., Augustin, J.-C. 2005. Influence of stress on individual lag time distributions of Listeria monocytogenes. Appl. Environ. Microbiol. 71, 2940-2948. Augustin, J.-C., Zuliani, V., Cornu, M., Guillier, L. 2005. Growth rate and growth probability of Listeria monocytogenes in dairy, meat and seafood products in suboptimal conditions. J. Appl. Microbiol. 99, 1019-1042. Augustin, J.-C., Carlier, V. 2006. Lessons from the organization of a proficiency testing program in food microbiology by interlaboratory comparison: analytical methods in use, impact of methods on bacterial counts and measurement uncertainty of bacterial counts. Food Microbiol. 23, 1-38.
Antoine Gessain est Docteur en Médecine (Université Paris V), ancien interne des Hôpitaux de Paris (1981-1989). Il obtient une Habilitation à Diriger les Recherches à Université Paris VII en 1997. De 1983 à 1984, il est responsable d'enquêtes épidémiologiques de terrain sur le rétrovirus HTLV-1 et la pathologie associée ; il a effectué un stage post-doctoral dans le laboratoire de biologie des cellules tumorales (LTCB) du Dr. RC. Gallo au NCI/NIH (Bethesda, USA). De 1991-1998, il est chargé de Recherche, puis chef de laboratoire à l'Institut Pasteur, dans l'Unité du Pr G. de Thé puis du Pr L. Montagnier. Depuis 2001, il est chef de l'Unité d'Epidémiologie et Physiopathologie des Virus Oncogènes (EPVO). Il a obtenu de nombreux prix scientifiques, dont le Prix d'Investigation clinique (1994) de la FRM, le Prix Thérèse Lebrasseur (1996) de la Fondation de France, le Prix Albert Sézary (1997), le Prix de l'Académie Nationale de Médecine (2003) et le Prix Victor Noury (2003) de l'Académie des Sciences. Il a été co-organisateur de la septième Conférence Internationale de Rétrovirologie Humaine (HTLV-1/2) en octobre 1995, et du Congrés International sur les Herpèsvirus HHV6-8 en mai 2001. Il est co-directeur du cours de « Virologie Sytématique » depuis 1999 et co-directeur du cours « Circulation des Agents Infectieux et Maîtrise du risque » à l'Institut Pasteur depuis 2003. Il est actuellement membre du Conseil d'orientation de l'Ecole Pasteurienne d'Infectiologie et membre du Conseil Scientifique de l'Ecole Pasteur /CNAM. Il a été membre de la Commission Scientifique « maladies transmissibles » de l'INSERM (1995-1999), membre du Conseil Scientifique de l'Institut Pasteur (2002-2005, vice-président en 2003) et membre du Conseil d'Administration de l'Institut Pasteur depuis 2005. Ses activités comprennent de très nombreuses collaborations avec le Réseau International des Instituts Pasteur et les Instituts Associés. Antoine Gessain est auteur de 300 publications, avec plus de 7500 citations, principalement dans le domaine des aspects épidémiologiques, cliniques et moléculaires des rétrovirus HTLV-1/STLV-1 et de l'herpèsvirus 8 et des maladies associées tumorales ou neurologiques.
Yoann Madec est ingénieur biostatisticien ; il est titulaire d'un Doctorat en Mathématiques, mention (Université Paris 5) et d'un D.E.A. de Santé Publique, option Biostatistique (Paris 11). Depuis janvier 2005, il travaille au sein de l'Unité d'Epidémiologie des Maladies Emergentes, Institut Pasteur (Paris), dirigée par le docteur Arnaud Fontanet. Ses travaux portent essentiellement sur l'analyse de cohortes de patients VIH+ en pays en développement. Dans le cadre de son travail à l'Institut Pasteur, il enseigne les Méthodes d'analyse des données de survie (Ecole pasteurienne d'infectiologie et module du Master d'épidémiologie et Santé Publique et Management de la Santé, option épidémiologie (Paris 6)) Par ailleurs, il participe depuis 2003 aux enseignement de l'Ecole d'été de santé publique au Kremlin-Bicêtre (Paris 11), et a enseigné les statistiques au CESAM (Centre d'Enseignement Appliqué à la Médecine), option SPEC (pratique des essais cliniques) (Paris 7). Publications et communications Madec Y, Boufassa F, Avettand-Fenoel V, Hendou S, Melard A, Boucherit S, Surzyn J, Meyer L and Rouzioux C for the ANRS SEROCO/HEMOCO study group. Early control of HIV-1 infection in long-term non progressors (LTNPs) followed since diagnosis in the ARNS SEROCO/HEMOCO Cohort. JAIDS, sous presse. Madec Y, Laureillard D, Pinoges L, Fernandez M, Prak N, Ngeth C, Moeung S, Song S, Balkan S, Ferradini L, Quillet C, Fontanet A. Response to highly active antiretroviral therapy among severely immuno-compromised HIV-infected patients in Cambodia. AIDS 2007; 30: 351-360. Madec Y, Boufassa F, Porter K, Meyer L on behalf of the CASCADE collaboration. Spontaneous control of viral load and CD4 progression among HIV-1 seroconverters in CASCADE. AIDS 2005; 19: 20017. Lambotte O, Boufassa F, Madec Y, Nguyen A, Goujard C, Meyer L, Rouzioux C, Venet A, Delfraissy J-F, and the SEROCO-HEMOCO Study Group. HIV Controllers: A Homogeneous Group of HIV-1-Infected Patients with Spontaneous Control of Viral Replication. CID 2005; 41: 105356. Madec Y, Boufassa F, Rouzioux C, Delfraissy J-F, Meyer L. Undetectable viremia without antiretroviral therapy in patients with HIV seroconversion: an uncommon phenomenon ? CID 2005; 40: 135054. Madec Y, Japhet C. First passage time problem for a drifted Ornstein-Uhlenbeck process. Mathematical Bioscience 2004; 189: 13140.
Chercheur Epidémiologiste à l'INSERM, Muriel Vray (MV) est spécialisée en recherche clinique et en Pharmaco-Epidémiologie. Elle travaille plus particulièrement sur la méthodologie des essais pragmatiques et des études de stratégie thérapeutique. Elle participe à l'établissement de recommandations nationales et internationales sur la méthodologie des essais d'équivalence ou de non-infériorité. Mise à disposition auprès de l'Institut Pasteur (IP) depuis 2002, MV collabore avec les épidémiologistes du réseau international (IP) au développement de la recherche clinique dans le domaine des maladies infectieuses. Expert auprès de plusieurs commissions de l'AFSSAPS (AMM, Groupe VIH et Hépatites, Groupe Intérêt et Santé Publique, Groupe essais cliniques) de l'ANRS (AC24 et CSS6) et de l'INSERM (comité d'experts du bureau Recherches Biomédicales), MV est responsable ou participe à divers enseignements sur la méthodologie des essais cliniques et la pharmaco-épidémiologie (DEA, DIU, CESAM..). MV a coordonné la méthodologie de plusieurs essais thérapeutiques multicentriques dans le domaine du VIH et des hépatites en France, en Afrique et en Asie pour l'ANRS et l'Institut Pasteur et conduit plusieurs études d'épidémiologie descriptive dans le domaine des pathologies métaboliques chroniques.